COMRAD - Cattle Comparative Radiation Hybrid Map

Marker Table for Chromosome 4

Framework
markers
Marker IDPrimer 1Primer 2Retention
Frequency
Gene Names
F3 AGLA227 TTAGAGCATAGTTGATTTAAAATGC CACAGGAAACTCTACTCAATATTC 0.138   
 BL1024 CACTCGGAATTCTCCAGAGC TTGATGTCTCAGTCAATCTCCC 0.128   
 BL1030 TTGATGGATGAATGGGTAAAG ATCTTGCTTCCATACCATGC 0.143   
F3 BL1121 CCAGGCTAGGAAGGCAGTAG AGGGTACAAAAATCCCACACC 0.191   
 BM1224 AGGAACCACATTGGGTAGTCC TCCCTCTCTCCCTGAGGC 0.187   
 BM1260 AAGTACATGCATGCTGCTGC TCCTAAGTTCCATCAACAGGTG 0.326   
F2 BM6315 CCTGAATGAATATGTGTGAGCA CTTGCCAGTGATGTCATGCT 0.106   
 BM6437 GAGGAAATACAGAACTCAGCCG TCAAACAGCATCTAGGCGG 0.17   
 BM6458 AAATTTAACCCTTTGGAAAAGC AGTGTGGGGTAGAGCACTGG 0.174   
 BMC1410 AAGGCTAAAGGATGCAGGAG CACATTGCTCAGCATCCATC 0.223   
 BMS1074 CAGTAGCCAAGATATGGAAGCA AGCTCCTTGCTGCTACAAATG 0.128   
 BMS1237 GTTTTCACTAGCACCCTGTGG CCCAGTTAACCCTAGAGTCGG 0.213   
 BMS1634 CAATAGTCTTCACAGTCCTCCC GCAAAGAATTGAACATGACTGA 0.196   
 BMS1788 ACGTCCAGATTCAGATTTCTTG GGAGAGGAATCTTGCAAAGG 0.16   
 BMS1840 TTTCAGCTGTTCACTTAGCTGC AAATCCACCCGAAGTATGAGG 0.255   
 BMS1878 GAAATTGCCCAAGACTGAATG TTACTACACCAGCTTTTGTGCC 0.215   
F2 BMS2571 CCCCAGTGATGTTCACACAG CAGCTGTCCAGCATCTGAAG 0.181   
 BMS2646 CAAAGCCATAAGAAGCAATTATG CCTTCTATAGTGTGGTGACTACCC 0.213   
F2 BMS2809 ATTTGCTGCCCTTGTGTTG TCAAAAGTCCCTGCTAGAATCC 0.237   
 BMS3002 TTGAAATTGGCCAGGTGAC GTCAAGGCTGTCAAGGCC 0.17   
F1 BMS495 CTTTCACAACCGAAAGACAATC TCACACCCCTTCCTCTCTTC 0.141   
 BMS648 ACTTCCCATCCATCCATCAG CTTCCATTCTCAGCCATCTAGC 0.151   
F2 BMS779 TCTTGTGGGGGAACCTCTA TGCTTGGAAGTATACATGATGG 0.172   
 BMS789 TGCAAGCTAGTCCTTTCTGATG GCAAGCAAGCTCCACTAACC 0.211   
F2 BMS8233 GCATTGGCAAGTGGATTCTT AAGGCAATTAACACATACATCACC 0.223   
 BMS827 GGACCAACTGCACAAATTCT AAGTGAAATTACTAGTGGGGTGTG 0.17   
F1 BMS885 AATATGTGTTCCATGCCAAATG TTCAGCATTAGTCCTTCCAATG 0.226   
F3 BR6303 TGAGCCATAGAATTAAGATTCAAGC TTTGTTCCTCTTTATTTTCTTCTGC 0.133   
 CSSM14 AAATGACCTCTCAATGGAAGCTTG AATTCTGGCACTTAATAGGATTCA 0.198   
 DIK026 TGCTGAGTGTGATTCCTGAG AAATAACCTTGAGACTACGGTA 0.187   
 DIK063 AGACAGACCATTGGCAAAGGG CTACAGTCCACAGGGCTGCA 0.109   
F2 HEL25 TCATCAGCCAGAGATAGTGC AGGCTACAGTCCATGGGATT 0.118   
F1 HUJ673 GCAAGTGCTCCACAAAGCCT GCCTTTTGGTGACAGAGTTGC 0.181   
 IDVGA51 ATGGCAATATTTTGTTCTTTTTC ATTCCTTGATGGTCTAATGGTTA 0.174   
F2 INRA072 CTTAACTCATTCACCTCAACTG AGTGATTGAGCACATTGCGCAT 0.086   
 LEP* GATGCAGCAGACCAAGTGG CCCATTGCTAGAACCCAGG 0.16 leptin 
F1 MAF50 GTAGACTACTCATGAAAATCAGGTCTTAGG GGGACATGCAGCTATACACTTGAG 0.149   
F1 MAF70 CACGGAGTCACAAAGAGTCAGACC GCAGGACTCTACGGGGCCTTTGC 0.176   
 McM218 CACTAAAAGCTTATGAAAGTTCCAGC GATCCTAGCATCAGTCTCCAGATG 0.16   
 MGTGB4 GAGCAGCTTCTTTCTTTCTCATCTT GCTCTTGGAAGCTTATTGTATAAAG 0.183   
 OarCP26 GGCCTAACAGAATTCAGATGATGTTGC GTCACCATACTGACGGCTGGTTCC 0.207   
 RM067 AGGGACCCTGGAGTATTTGG GTGGAAAGCTGCCCTATCTG 0.194   
 RM088 GATCCTCTTCTGGGAAAAGAGAC CCTGTTGAAGTGAACCTTCAGAA 0.191   
 RM188 GGGTTCACAAAGAGCTGGAC GCACTATTGGGCTGGTGATT 0.17   
F1 TGLA116 GCACAGTAATAAGAGTGATGGCAGA TGGAGAAGATTTGGCTGTGTACCCA 0.234   
 TGLA159 GCATCCAGGGAACAAATTACAAAC TTTATTTCGAATCTCTTGAGTACAG 0.185   
F2 TGLA215 GCTAGGTGATGCACTTTATACACTT CATACATAACTGAGTGACTTAGCAT 0.152   
Markers below are Not included in the map
 INRA37 GATCCTGCTTATATTTAACCAC AAAATTCCATGGAGAGAGAAAC 0.181   
  • Back to the chromosome panel
  • Data from http://www.projects.roslin.ac.uk/comrad/introduction.html
  • Contact: Dr John Williams
  • [an error occurred while processing this directive]